Termuxのホームディレクトリは次の通り。Androidアプリのディレクトリ構成ですね。なのでTermuxのファイルはAndroidの管理下にあります。

/data/data/com.termux/files/home

一方、Pixelに提供されているLinuxターミナルのホームディレクトリは次の通りで、一般的なLinuxのディレクトリ構成と同じです。

/home/droid

このあたりもLinuxターミナル優位となる一因です。